凡貪瀆案件，無論係各執行小組自行受理，或其他機關移送偵辦者，均依照規定分案列管、追蹤。

各地方檢察署肅貪執行小組辦理貪瀆案件經一審法院判決無罪者，按季陳報本署督導小組檢察官審查彙整後陳報法務部，發現有偵查欠當情形即指示改進措施以為上訴二審之參考，期能提高案件定罪率。

貪瀆案件因在犯罪型態上屬「共犯結構(即行賄者及受賄者)」，並無第三證人存在，故犯罪證據之蒐證至為困難，其定罪率本即不易提高，中外皆然。惟自82年10月1日本案推展迄今，無論新收案件、起訴件數及人數，都創下「貪污治罪條例」施行三十多年來之最高紀錄，而於判決確定的案件中，定罪率亦逐步提昇，顯示檢察機關嚴辦貪瀆，戮力以赴之績效。本署肅貪督導小組成立迄今，持續檢討並不斷研議改進，於組織編組及實務運作上均已步入軌道，發揮具體功能。惟欲達致弊絕風清之境界，仍有賴持續不斷的努力。